table isimlerini değiştiren sorguyu php ile döngü içine alabilirsin...
$query = $this->db->query("show tables")->rows;
foreach($query as $key=>$value ){
$this->db->query("RENAME TABLE ".$value." TO new_tbl_name");
}
$value tablonun şimdiki adı.... silmek istediğin kısmı str_replace() ile kaldırabilirsin...