Sorunu giderdim. Şöyle ki,
system/library/session.php'deki
#@ini_set('session.use_cookies', 'Off');
#@ini_set('session.use_trans_sid', 'Off');
kodların başına bu şekilde # ekledim ve devre dışı bıraktım.
Fakat bu kalıcı bir çözüm olmayabilir.PHPSESSID çerezleri logout olunca da duruyor...